Ο αρχηγός της Εθνικής Ομάδας του 2004, Θ. Ζαγοράκης, είναι ο νέος πρόεδρος της ΕΠΟ. Ο αντίπαλος του Κ. Νίκας απέσυρε την υποψηφιότητα του στο παρά πέντε και ο Ζαγοράκης εξελέγη με 66 ψήφους επί 68 εκλεκτόρων (απείχε η ΕΠΣ Σάμου).
Στο διοικητικό συμβούλιο της ομοσπονδίας εξελέγησαν τα 11 μέλη που στήριξαν η ΑΕΚ και ο ΠΑΟΚ. Αναλυτικότερα:
-Στέργιος Αντωνίου με 63 ψήφους
-Παναγιώτης Δημητρίου με 59 ψήφους
-Γιώργος Χατζησαρόγλου με 54 ψήφους
-Μάνος Γαβριηλίδης με 53 ψήφους
-Δημοσθένης Κουπτσίδης με 52 ψήφους
-Δημήτρης Μπουχλαριώτης με 51 ψήφους
-Λεωνίδας Θωμαϊδης με 50 ψήφους
-Τάκης Παπαχρήστος με 50 ψήφους
-Κλέαρχος Τζαφέρης με 49 ψήφους
-Κυριάκος Φύτρας με 48 ψήφους
-Άγγελος Δανιήλ με 47 ψήφους
Εκτός συμβουλίου έμειναν οι διεθνείς: Άγγελος Χαριστέας (τον υπέδειξε η ΕΠΣ Κέρκυρας), Δημήτρης Παπαδόπουλος (τον υπέδειξε η ΕΠΣ Ρεθύμνου), Γιώργος Ανατολάκης (πρόεδρος ΕΠΣ Πειραιά), Παντελής Καφές (τον υπέδειξε η ΕΠΣ Λασιθίου).
Αναλυτικά δεν εκλέγονται οι:
-Βίκυ Δημητρακοπούλου με 16 ψήφους
-Δημήτρης Παπαδόπουλος με 15 ψήφους
-Γιώργος Ανατολάκης με 14 ψήφους
-Άγγελος Χαριστέας με 14 ψήφους
-Παντελής Καφές με 13 ψήφους
-Κώστας Κωνσταντινίδης με 13 ψήφους
